| 2024（令和6） |
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「科学館のたからもの～収蔵庫展～」「ドキドキ探検！３Dミステリーゾーン」
2024.2 チケット販売機・入場ゲート更新
2024.3 外壁工事終了 |
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| 2023（令和5） |
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「昭和家電を科学する」「鏡の魔法展」「ながさきの未来を考える！」
2023.12 プラネタリウム専用プロジェクター「バーチャリウム」の装置更新 |
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| 2022（令和4） |
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「長崎電車展」「こわさの不思議を科学する」「文具を科学する」
2022.5 マイペットボトル用冷水器設置
2022.7 プラネタリウムに空気浄化システム導入 |
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| 2021（令和3） |
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「電気の道」「貝がら展とむしむし展」「水を科学する」 |
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| 2020（令和2） |
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「収蔵庫展！」
新型コロナウイルス世界的流行に伴い臨時休館
4/1 指定管理者三期目スタート（長崎ダイヤモンドスタッフ㈱） |
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| 2019（令和1） |
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「ワクワク魔法のワンダーランド」「服部正志トリック3Dアート～カメラの向こうは不思議な世界～」「段ボールを科学する」 |
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| 2018（平成30） |
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「不思議な科学館」「妖怪からくり屋敷」「錯覚ワールド」
12/22 展示室リニューアルオープン
「草野仁科学賞」作品募集開始 |
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| 2017（平成29） |
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「長崎市科学館」開館20周年
3/27 第一天文台望遠鏡リニューアル（50cm反射望遠鏡）
「服部正志の衝撃！3DアートⅢ～魔法の絵画展～」「大アマゾン展」「むしむし展」「にゃがさきネコ展」 |
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| 2016（平成28） |
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「服部正志の衝撃！3Dアート展～マジカル写真館～」「3D恐怖の幽霊船」「昆虫展」「陶磁器を科学する」 |
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| 2015（平成27） |
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「服部正志の衝撃！3Dアート展～とびだす魔法の絵画～」「ダイナソー･ワールドⅡ大恐竜王国」「飛ぶを科学する」「貝の世界展2015」
4/1 指定管理者二期目スタート（長崎ダイヤモンドスタッフ㈱） |
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| 2014（平成26） |
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「とびだすおばけ屋敷」「ドラゴン城の冒険」「なるほど からだのふしぎ展」
3/25 スペースシアターリニューアルオープン（五藤光学ケイロンⅡ）
8/25 開館250万人達成、8/31記念トークショー開催（草野名誉館長と田上市長）
10/15.16 長崎国体 体操競技をシアターでパブリックビューイング |
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| 2013（平成25） |
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「おもちゃワールド」「時間旅行展」「収蔵庫展」「宇宙への扉」
9/17~3/24 スペースシアター改装工事 |
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| 2012（平成24） |
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「トリックアート迷宮館」「ワイルドアマゾン展」「音の世界展」「貝の世界展」 |
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| 2011（平成23） |
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「トリックアート展」「ダイナソー･ワールド」「働く船たち」
全天周映画 フィルム式からプロジェクター投影に変更、ペルセウス座流星群観望会をビッグN野球場で開催 |
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| 2010（平成22） |
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指定管理制度導入 長崎ダイヤモンドスタッフ㈱が運営、草野仁名誉館長就任
「特別展トレジャーハンター」 |
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| 2008（平成21） |
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指定管理者公募開始 |
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| 2008（平成20） |
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「昆虫展」 |
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| 2007（平成19） |
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「太陽観察ライブカメラ」開始 |
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| 2006（平成18） |
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「大恐竜王国展」 |
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| 2005（平成17） |
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「深海の不思議展」
市内小学生団体見学学習が6年生から5年生に変更 |
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| 2004（平成16） |
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「金星太陽面通過記念展」「グレートアマゾン展」 |
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| 2003（平成15） |
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「特別展スペースツアー」開催、夏休み期間中の休館日廃止 |
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| 2002（平成14） |
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「科学館が贈る 世界の切手展」 |
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| 2001（平成13） |
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「掘りたて恐竜展」 |
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| 2000（平成12） |
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「プラネタリウムの夕べ」開始 |
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| 1999（平成11） |
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「市内小学生団体見学学習」開始 |
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| 1998（平成10） |
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「スターシップフェスタ」初開催、「宇宙の日」記念絵画コンクール作品募集開始、「小中学校科学教育展」初開催 |
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| 1997（平成9） |
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油木町へ移転 4/26 「長崎市科学館」開館
「青少年のための科学の祭典長崎大会」初開催 |
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| 1991（平成3） |
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上銭座町へ移転 |
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| 1957（昭和32） |
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4/1 長崎市大浦町 旧英国領事館を改装し「長崎市児童科学館」開設 |
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